内含子是必须从初级RNA转录物中丢弃的DNA区域。最常见的是真核RNA类，主要位于信使RNA中，就像它们可以位于某些rRNA和原核tRNA中一样。内含子的数量和维度在物种之间非常不同。它们是化学家菲利普斯·艾伦·夏普和理查德·J·罗伯茨首次发现的。
这些专家对内含子的研究使他们值得诺贝尔生理学和医学奖。然而，“内含子”一词是由生物化学家沃尔特·吉尔伯特（Walter Gilbert）于1978年发现的。
内含子可以代表``剪接''的一个可选区域，更好地被称为``剪接''，能够产生不同形式的蛋白质。剪接过程将由各种各样的分子信号控制。另一个有趣的事实是，内含子还可以包含旧数据，也就是说，它们可以包含以前可能已经表达但目前不表达的部分基因。
经典理论都肯定了内含子片段的DNA没有信息，虽然此信息是在辩论和现在它没有很多的支持者。
内含子分为：
- 一级内含子。
- II类内含子。
- III类内含子。
- IV级内含子。
I和II类内含子倾向于通过酯交换反应遭受剪接体（剪接复合体）的侵害。有可能在基因组中找到这组内含子的时间相对较少。II类和III类内含子非常相似，并且具有高度保守的次级系统。IV类内含子存在于真核tRNA中，其独特之处是通过内切核苷酸而被丢弃的唯一内含子。
内含子可以在多细胞真核生物（例如人）中频繁发现，而在单细胞真核生物（例如酵母）中则较少见。就古细菌和细菌而言，它们很少见。
